在阿雷格里港，联邦众议员莱昂内尔·布里佐拉和陆军第三军军长拉达里奥·特莱斯将军力主武装抵抗政变。但古拉特认为，若武装抵抗政变军队，无疑将发展成一场内战，决定自己出国流亡而不愿造成众多伤亡。于是，古拉特一行于4月2日夜离开阿雷格里港，到本州内地躲藏，4月4日来到乌拉圭首都蒙得维的亚，开始了漫长的流亡生活。
1964年3月31日的军事政变取得了完全的成功，建立起以卡斯特卢·布朗库为首的军人独裁政权。军政府实行专制统治，在政变过程中以及政变成功之后，先后有上千名左派、进步人士被杀害，近万人被关押和拷打，约10万名巴西人流亡国外。1965年11月军政府宣布取消所有原有政党，实行两党制，到1979年底才恢复多党制。
军政府共经历过五任总统，即五位元帅或将军先后出任总统。由于军政府严格限制工人罢工和政治鼓动，使经济得到发展，使巴西在1968年至1972年间的国内生产总值平均年增长率达11％左右，巴西经济得以腾飞，这被称为“巴西经济奇迹”。